Ingénieur de recherche en Neuro-Imagerie

Détails de l’offre:

– Intitulé du poste: Ingénieur de recherche en développement d’applications (Traitement de données d’imagerie cérébrale)

– Type de contrat: Contrat à durée déterminée

– Durée: 2 ans

– Date de prise de fonction souhaitée : Février 2021

– Structure: Inserm, Inserm UMR-S U1237, Université de Caen-Normandie, GIP Cyceron, Boulevard H. Becquerel, 14000 Caen

– BAP: BAP E (Informatique, Statistique et Calcul Scientifique : Etudes, développement et déploiement)

Descriptif de l’emploi:

• Composition de la structure :

L’équipe « Multimodal Neuroimaging of Brain Diseases », dirigée par le Dr. Gaëlle Chételat, s’articule autour de quatre domaines de recherche : i) améliorer les biomarqueurs d’imagerie cérébrale pour le diagnostic précoce de la maladie d’Alzheimer ; ii) apporter une meilleure compréhension des mécanismes physiopathologiques de la maladie d’Alzheimer via une approche multimodale en neuroimagerie ; iii) explorer les relations entre les facteurs de style de vie et les biomarqueurs cérébraux de la maladie d’Alzheimer et iv) développer des interventions non-pharmaceutiques pour promouvoir le bien-être et la santé mentale auprès de population âgée. Ainsi, l’équipe est investie dans deux programmes de recherche clinique de grande envergure : IMAP+ (Imagerie Multimodale de la maladie d’Alzheimer à un stade Précoce) et Silver Santé Study. Brièvement, IMAP+ est une étude longitudinale en imagerie cérébrale portant sur des sujets sains âgés et des patients à un stade précoce, voire préclinique, de la maladie d’Alzheimer. Silver Santé Study est pour sa part une étude Européenne impliquant 6 pays et qui se déroule pour sa plus grande partie à Caen. Cette étude vise à étudier les effets cognitifs et cérébraux d’un apprentissage de l’anglais versus d’un entraînement à la régulation du stress et des émotions par la pratique de la méditation dans le contexte du vieillissement normal.

L’équipe du Dr. Gaëlle Chételat est affiliée à l’Unité INSERM U1237 du Pr. Denis Vivien. Cette unité, mondialement reconnue pour son expertise dans le domaine des protéases, a pour tutelles l’Inserm et l’Université de Caen Normandie. Elle est basée à Cyceron (Caen), une plate-forme d’imagerie au sein de laquelle sont menées des recherches biomédicales principalement dans le domaine des neurosciences. La plateforme fourni un environnement particulièrement favorable à la recherche puisqu’elle héberge un ensemble unique de laboratoires et d’instruments, dont un cyclotron, deux caméras à positons de type TEP-CT et deux appareils d’IRM à très haut champ.

• Missions :

L’ingénieur d’étude implémentera de nouvelles bases de données d’imagerie et développera des méthodes de traitement et d’analyse de données d’imagerie cérébrale (e.g., IRM fonctionnelle, DTI, ASL) dans le contexte du vieillissement normal et pathologique.

• Activités :
• Mettre en place des bases de données de neuroimagerie libres d’accès (e.g., ADNI, DIAN)
• Concevoir des procédures de contrôle qualité pour les données d’imagerie
• Développer des méthodes de prétraitements et d’analyses en imagerie cérébrale (e.g., IRM fonctionnelle au repos, DTI, ASL, TEP)
• Interagir et diffuser, en interne et en externe, les principes et la mise en œuvre des techniques de l’analyse des données de neuroimagerie
• Réaliser l’analyse de données issues des bases de données
• Diffuser et valoriser les résultats sous forme de rapports techniques, de publications ou de présentations orales auprès des communautés professionnelles et scientifiques
• Orienter et conseiller les utilisateurs pour la mise en œuvre des méthodes d’études et d’interprétation des résultats

• Compétences :
• Expérience indispensable en neuroimagerie
• Maitrise de la programmation sous Matlab et si possible dans d’autres langages (R, Python, C++, Perl)
• Connaissance approfondie d’un ou plusieurs logiciels de traitement des données d’imagerie cérébrale (e.g., SPM, FSL, Freesurfer)
• Expertise dans une modalité d’imagerie particulière (e.g., IRMf, DTI) et/ou expérience dans le domaine du vieillissement normal et pathologique appréciée

• Savoir-faire :
• Travailler en interaction avec une équipe pluridisciplinaire (chercheurs, étudiants, ITA…)
• Garantir la qualité et la pertinence des outils d’analyse et des résultats
• Choisir un ensemble cohérent d’outils mathématiques, statistiques et informatiques adaptés au traitement des données.
• Veiller au respect des règles de bonne pratique clinique
• Maîtriser les techniques de présentation (écrites et orales)
• Anglais : expression et compréhension orales : niveau 2

• Formation souhaitée : BAC +5
• Expérience souhaitée : oui
• Candidature : CV et lettre de motivation
• Contacts : Géraldine Poisnel : poisnel@cyceron.fr